Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga4Q00651 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms