Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GabpaQ00422 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms