Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp10Q000W5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms