Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry1P97784 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry1P97784 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry1P97784 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry1P97784 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry1P97784 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry1P97784 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry1P97784 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry1P97784 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry1P97784 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry1P97784 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry1P97784 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cry1P97784 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry1P97784 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry1P97784 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry1P97784 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms