Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms