Protein–RNA interactions for Protein: P83503

Nyx, Nyctalopin, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NyxP83503 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NyxP83503 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NyxP83503 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NyxP83503 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NyxP83503 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NyxP83503 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NyxP83503 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NyxP83503 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NyxP83503 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NyxP83503 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NyxP83503 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NyxP83503 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NyxP83503 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NyxP83503 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NyxP83503 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NyxP83503 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NyxP83503 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NyxP83503 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NyxP83503 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NyxP83503 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NyxP83503 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NyxP83503 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NyxP83503 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NyxP83503 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NyxP83503 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NyxP83503 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NyxP83503 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NyxP83503 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NyxP83503 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NyxP83503 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NyxP83503 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NyxP83503 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NyxP83503 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NyxP83503 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NyxP83503 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NyxP83503 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NyxP83503 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NyxP83503 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NyxP83503 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NyxP83503 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NyxP83503 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NyxP83503 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NyxP83503 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NyxP83503 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NyxP83503 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NyxP83503 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NyxP83503 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NyxP83503 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NyxP83503 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NyxP83503 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NyxP83503 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NyxP83503 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NyxP83503 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NyxP83503 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NyxP83503 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NyxP83503 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NyxP83503 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NyxP83503 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NyxP83503 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NyxP83503 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NyxP83503 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NyxP83503 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NyxP83503 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NyxP83503 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NyxP83503 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NyxP83503 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NyxP83503 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NyxP83503 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NyxP83503 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NyxP83503 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NyxP83503 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NyxP83503 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NyxP83503 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NyxP83503 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NyxP83503 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NyxP83503 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NyxP83503 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NyxP83503 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NyxP83503 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NyxP83503 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NyxP83503 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NyxP83503 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NyxP83503 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NyxP83503 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NyxP83503 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NyxP83503 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NyxP83503 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NyxP83503 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NyxP83503 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NyxP83503 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NyxP83503 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NyxP83503 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NyxP83503 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NyxP83503 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NyxP83503 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NyxP83503 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NyxP83503 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NyxP83503 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NyxP83503 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NyxP83503 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms