Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcdP82347 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcdP82347 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcdP82347 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcdP82347 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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