Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx3P81067 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx3P81067 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx3P81067 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx3P81067 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Irx3P81067 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Irx3P81067 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms