Protein–RNA interactions for Protein: P80313

Cct7, T-complex protein 1 subunit eta, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct7P80313 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct7P80313 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct7P80313 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct7P80313 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct7P80313 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cct7P80313 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms