Protein–RNA interactions for Protein: P79568

H2-Q6, Class Ib MHC antigen Qa-2, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q6P79568 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q6P79568 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms