Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms