Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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