Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shox2P70390 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shox2P70390 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Shox2P70390 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shox2P70390 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shox2P70390 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shox2P70390 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shox2P70390 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms