Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rad50P70388 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rad50P70388 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rad50P70388 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad50P70388 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad50P70388 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad50P70388 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad50P70388 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad50P70388 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad50P70388 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rad50P70388 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms