Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad1P70340 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad1P70340 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad1P70340 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad1P70340 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad1P70340 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad1P70340 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms