Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrig1P70193 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms