Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtnP63089 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtnP63089 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtnP63089 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtnP63089 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtnP63089 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtnP63089 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtnP63089 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtnP63089 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtnP63089 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PtnP63089 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtnP63089 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtnP63089 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtnP63089 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtnP63089 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtnP63089 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtnP63089 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtnP63089 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtnP63089 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtnP63089 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtnP63089 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtnP63089 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtnP63089 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PtnP63089 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtnP63089 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtnP63089 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtnP63089 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtnP63089 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtnP63089 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PtnP63089 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtnP63089 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtnP63089 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtnP63089 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PtnP63089 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtnP63089 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtnP63089 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtnP63089 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtnP63089 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtnP63089 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtnP63089 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtnP63089 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtnP63089 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtnP63089 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtnP63089 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtnP63089 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtnP63089 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtnP63089 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtnP63089 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtnP63089 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtnP63089 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PtnP63089 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtnP63089 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtnP63089 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtnP63089 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtnP63089 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtnP63089 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtnP63089 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtnP63089 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtnP63089 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtnP63089 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtnP63089 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtnP63089 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtnP63089 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtnP63089 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtnP63089 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtnP63089 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtnP63089 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtnP63089 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtnP63089 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtnP63089 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtnP63089 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtnP63089 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PtnP63089 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtnP63089 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtnP63089 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PtnP63089 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtnP63089 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtnP63089 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtnP63089 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtnP63089 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtnP63089 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtnP63089 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtnP63089 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtnP63089 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtnP63089 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtnP63089 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtnP63089 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PtnP63089 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtnP63089 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtnP63089 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtnP63089 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtnP63089 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtnP63089 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtnP63089 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtnP63089 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtnP63089 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtnP63089 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtnP63089 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtnP63089 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtnP63089 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms