Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3P62908 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3P62908 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3P62908 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3P62908 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3P62908 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3P62908 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3P62908 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps3P62908 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps3P62908 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps3P62908 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms