Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rps29P62274 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rps29P62274 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rps29P62274 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rps29P62274 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
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