Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Copz1P61924 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Copz1P61924 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Copz1P61924 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Copz1P61924 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Copz1P61924 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Copz1P61924 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Copz1P61924 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Copz1P61924 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Copz1P61924 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Copz1P61924 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Copz1P61924 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Copz1P61924 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Copz1P61924 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copz1P61924 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copz1P61924 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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Copz1P61924 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Copz1P61924 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Copz1P61924 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Copz1P61924 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Copz1P61924 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Copz1P61924 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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Copz1P61924 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Copz1P61924 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Copz1P61924 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Copz1P61924 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Copz1P61924 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Copz1P61924 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms