Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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Vbp1P61759 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Vbp1P61759 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vbp1P61759 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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