Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Depdc5P61460 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Depdc5P61460 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms