Protein–RNA interactions for Protein: P61164

Actr1a, Alpha-centractin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr1aP61164 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Actr1aP61164 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Actr1aP61164 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Actr1aP61164 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actr1aP61164 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actr1aP61164 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Actr1aP61164 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Actr1aP61164 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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Actr1aP61164 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Actr1aP61164 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Actr1aP61164 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Actr1aP61164 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Actr1aP61164 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actr1aP61164 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actr1aP61164 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Actr1aP61164 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actr1aP61164 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actr1aP61164 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actr1aP61164 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actr1aP61164 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Actr1aP61164 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actr1aP61164 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actr1aP61164 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Actr1aP61164 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Actr1aP61164 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Actr1aP61164 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Actr1aP61164 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Actr1aP61164 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Actr1aP61164 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Actr1aP61164 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Actr1aP61164 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Actr1aP61164 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Actr1aP61164 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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Actr1aP61164 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actr1aP61164 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actr1aP61164 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actr1aP61164 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actr1aP61164 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actr1aP61164 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actr1aP61164 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Actr1aP61164 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actr1aP61164 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actr1aP61164 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actr1aP61164 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actr1aP61164 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actr1aP61164 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actr1aP61164 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actr1aP61164 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actr1aP61164 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Actr1aP61164 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Actr1aP61164 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Actr1aP61164 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Actr1aP61164 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms