Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CirbpP60824 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CirbpP60824 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CirbpP60824 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CirbpP60824 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CirbpP60824 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CirbpP60824 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CirbpP60824 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms