Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nphp4P59240 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nphp4P59240 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms