Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nup43P59235 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup43P59235 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup43P59235 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup43P59235 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nup43P59235 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup43P59235 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup43P59235 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nup43P59235 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup43P59235 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup43P59235 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup43P59235 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup43P59235 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup43P59235 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup43P59235 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup43P59235 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup43P59235 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup43P59235 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup43P59235 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup43P59235 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup43P59235 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup43P59235 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup43P59235 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup43P59235 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup43P59235 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup43P59235 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup43P59235 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup43P59235 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup43P59235 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup43P59235 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup43P59235 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup43P59235 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup43P59235 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nup43P59235 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup43P59235 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup43P59235 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup43P59235 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nup43P59235 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup43P59235 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup43P59235 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nup43P59235 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup43P59235 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup43P59235 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup43P59235 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nup43P59235 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nup43P59235 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nup43P59235 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nup43P59235 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nup43P59235 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nup43P59235 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nup43P59235 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup43P59235 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup43P59235 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup43P59235 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup43P59235 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup43P59235 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup43P59235 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup43P59235 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup43P59235 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup43P59235 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup43P59235 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup43P59235 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Nup43P59235 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nup43P59235 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup43P59235 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup43P59235 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup43P59235 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup43P59235 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup43P59235 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup43P59235 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup43P59235 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup43P59235 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Nup43P59235 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Nup43P59235 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nup43P59235 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nup43P59235 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup43P59235 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup43P59235 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nup43P59235 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup43P59235 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup43P59235 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup43P59235 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup43P59235 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup43P59235 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup43P59235 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup43P59235 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup43P59235 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup43P59235 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup43P59235 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup43P59235 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup43P59235 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup43P59235 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup43P59235 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup43P59235 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup43P59235 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup43P59235 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup43P59235 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup43P59235 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup43P59235 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup43P59235 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms