Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Samsn1P57725 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samsn1P57725 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms