Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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