Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sh3bp1P55194 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms