Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aqp4P55088 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms