Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SftpdP50404 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SftpdP50404 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SftpdP50404 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SftpdP50404 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpdP50404 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpdP50404 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpdP50404 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpdP50404 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpdP50404 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpdP50404 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SftpdP50404 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms