Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cav1P49817 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cav1P49817 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cav1P49817 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cav1P49817 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cav1P49817 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cav1P49817 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cav1P49817 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cav1P49817 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cav1P49817 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms