Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcls1P49710 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcls1P49710 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcls1P49710 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcls1P49710 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcls1P49710 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcls1P49710 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Hcls1P49710 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms