Protein–RNA interactions for Protein: P49312

Hnrnpa1, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hnrnpa1P49312 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hnrnpa1P49312 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hnrnpa1P49312 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hnrnpa1P49312 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hnrnpa1P49312 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hnrnpa1P49312 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hnrnpa1P49312 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hnrnpa1P49312 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hnrnpa1P49312 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hnrnpa1P49312 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hnrnpa1P49312 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hnrnpa1P49312 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hnrnpa1P49312 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hnrnpa1P49312 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hnrnpa1P49312 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hnrnpa1P49312 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hnrnpa1P49312 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hnrnpa1P49312 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hnrnpa1P49312 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hnrnpa1P49312 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms