Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnni3P48787 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms