Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gli1P47806 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gli1P47806 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gli1P47806 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gli1P47806 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gli1P47806 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gli1P47806 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms