Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrprbP47758 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SrprbP47758 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SrprbP47758 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrprbP47758 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrprbP47758 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrprbP47758 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms