Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Syt1P46096 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syt1P46096 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syt1P46096 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syt1P46096 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syt1P46096 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syt1P46096 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms