Protein–RNA interactions for Protein: P43247

Msh2, DNA mismatch repair protein Msh2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh2P43247 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msh2P43247 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msh2P43247 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msh2P43247 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msh2P43247 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Msh2P43247 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msh2P43247 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms