Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VhlP40338 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VhlP40338 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VhlP40338 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VhlP40338 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VhlP40338 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VhlP40338 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VhlP40338 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VhlP40338 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VhlP40338 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VhlP40338 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VhlP40338 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
VhlP40338 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VhlP40338 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VhlP40338 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VhlP40338 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VhlP40338 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VhlP40338 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VhlP40338 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VhlP40338 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VhlP40338 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VhlP40338 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VhlP40338 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VhlP40338 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VhlP40338 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
VhlP40338 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VhlP40338 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VhlP40338 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VhlP40338 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VhlP40338 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VhlP40338 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VhlP40338 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VhlP40338 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VhlP40338 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VhlP40338 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VhlP40338 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VhlP40338 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VhlP40338 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VhlP40338 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VhlP40338 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VhlP40338 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VhlP40338 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VhlP40338 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VhlP40338 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VhlP40338 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VhlP40338 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
VhlP40338 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
VhlP40338 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VhlP40338 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VhlP40338 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VhlP40338 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VhlP40338 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VhlP40338 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VhlP40338 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VhlP40338 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VhlP40338 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VhlP40338 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VhlP40338 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VhlP40338 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VhlP40338 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VhlP40338 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VhlP40338 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VhlP40338 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VhlP40338 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VhlP40338 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VhlP40338 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VhlP40338 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VhlP40338 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VhlP40338 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VhlP40338 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VhlP40338 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VhlP40338 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VhlP40338 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VhlP40338 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VhlP40338 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VhlP40338 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VhlP40338 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VhlP40338 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VhlP40338 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VhlP40338 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VhlP40338 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VhlP40338 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VhlP40338 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VhlP40338 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VhlP40338 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VhlP40338 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VhlP40338 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VhlP40338 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VhlP40338 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VhlP40338 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
VhlP40338 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VhlP40338 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VhlP40338 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VhlP40338 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VhlP40338 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VhlP40338 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VhlP40338 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VhlP40338 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VhlP40338 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VhlP40338 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms