Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ThpoP40226 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ThpoP40226 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ThpoP40226 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ThpoP40226 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ThpoP40226 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ThpoP40226 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ThpoP40226 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ThpoP40226 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ThpoP40226 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ThpoP40226 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ThpoP40226 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ThpoP40226 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms