Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf2P39429 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf2P39429 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf2P39429 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf2P39429 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf2P39429 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf2P39429 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf2P39429 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms