Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpargP37238 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpargP37238 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpargP37238 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpargP37238 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpargP37238 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PpargP37238 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpargP37238 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpargP37238 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpargP37238 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpargP37238 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpargP37238 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PpargP37238 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpargP37238 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PpargP37238 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpargP37238 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpargP37238 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpargP37238 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpargP37238 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpargP37238 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpargP37238 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpargP37238 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpargP37238 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PpargP37238 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpargP37238 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpargP37238 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpargP37238 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpargP37238 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpargP37238 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpargP37238 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpargP37238 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpargP37238 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpargP37238 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpargP37238 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpargP37238 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PpargP37238 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpargP37238 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PpargP37238 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpargP37238 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpargP37238 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpargP37238 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpargP37238 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpargP37238 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpargP37238 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpargP37238 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpargP37238 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpargP37238 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpargP37238 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpargP37238 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpargP37238 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PpargP37238 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpargP37238 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpargP37238 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpargP37238 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpargP37238 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpargP37238 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpargP37238 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpargP37238 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpargP37238 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpargP37238 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpargP37238 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpargP37238 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpargP37238 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpargP37238 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpargP37238 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpargP37238 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpargP37238 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpargP37238 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PpargP37238 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpargP37238 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpargP37238 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpargP37238 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpargP37238 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PpargP37238 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpargP37238 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpargP37238 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpargP37238 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpargP37238 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpargP37238 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpargP37238 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpargP37238 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpargP37238 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpargP37238 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpargP37238 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpargP37238 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PpargP37238 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpargP37238 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PpargP37238 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpargP37238 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpargP37238 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpargP37238 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpargP37238 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpargP37238 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpargP37238 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpargP37238 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpargP37238 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpargP37238 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpargP37238 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpargP37238 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpargP37238 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms