Protein–RNA interactions for Protein: P35441

Thbs1, Thrombospondin-1, mousemouse

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Length 1,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs1P35441 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Thbs1P35441 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Thbs1P35441 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Thbs1P35441 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Thbs1P35441 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs1P35441 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs1P35441 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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