Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab20P35295 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab20P35295 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab20P35295 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab20P35295 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab20P35295 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab20P35295 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab20P35295 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms