Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptpn11P35235 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn11P35235 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn11P35235 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn11P35235 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn11P35235 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn11P35235 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn11P35235 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn11P35235 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn11P35235 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn11P35235 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn11P35235 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn11P35235 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn11P35235 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn11P35235 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn11P35235 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn11P35235 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn11P35235 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn11P35235 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn11P35235 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn11P35235 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn11P35235 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn11P35235 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn11P35235 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn11P35235 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn11P35235 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn11P35235 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn11P35235 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn11P35235 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn11P35235 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn11P35235 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn11P35235 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn11P35235 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn11P35235 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn11P35235 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn11P35235 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn11P35235 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms