Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoc1P34928 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoc1P34928 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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