Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptk2P34152 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptk2P34152 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms