Protein–RNA interactions for Protein: P33610

Prim2, DNA primase large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim2P33610 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim2P33610 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim2P33610 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim2P33610 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim2P33610 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prim2P33610 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prim2P33610 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms