Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms